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    發(fā)布日期:2025/7/14 14:31:00

    實(shí)時(shí)定量PCRRT-qPCR是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,通過(guò)熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)量每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法,常用于定量分析特定DNA序列。

    RT-qPCR的實(shí)驗(yàn)操作流程:

    1、引物設(shè)計(jì):引物設(shè)計(jì)需遵循一般原則,產(chǎn)物長(zhǎng)度應(yīng)控制在80-150bp,以保證擴(kuò)增效率和特異性。

    RNA提?。禾崛〖?xì)胞總RNA,包括清洗、裂解、分離和沉淀RNA步驟。

    2RNA濃度測(cè)定:使用如Nano drop等儀器測(cè)定RNA濃度。

    3、反轉(zhuǎn)錄合成cDNA使用反轉(zhuǎn)錄酶將RNA轉(zhuǎn)換為cDNA,作為qPCR的模板。

    4、qPCR反應(yīng)體系配置:實(shí)驗(yàn)通常使用2×濃縮的real-time qPCR MasterMix。需要加入模板和引物。每個(gè)樣品至少做3個(gè)平行孔,以確保數(shù)據(jù)的可統(tǒng)計(jì)性。

    5、上機(jī)操作:將配置好的反應(yīng)液放入實(shí)時(shí)qPCR儀中,設(shè)置相應(yīng)的溫度循環(huán)和采集模式,進(jìn)行擴(kuò)增檢測(cè)。real-time qPCR不需要常規(guī)PCR的三步法(變性、退火、延伸)。 由于產(chǎn)物長(zhǎng)度短(80-150 bp),通常只需要變性和退火步驟。 使用SYBR Green等染料時(shí),PCR后應(yīng)加溶解程序以形成溶解曲線,判斷特異性擴(kuò)增。

    6、數(shù)據(jù)分析:通過(guò)擴(kuò)增曲線和融解曲線分析,可進(jìn)行相對(duì)定量或絕對(duì)定量分析。相對(duì)定量用于比較靶基因在不同樣本中的表達(dá)差異,絕對(duì)定量用于測(cè)定樣本中靶基因的確切拷貝數(shù)。

    7、常見(jiàn)問(wèn)題分析:注意MasterMix不要反復(fù)凍融,常使用時(shí)可溶解后存放于4°C。 配制時(shí)應(yīng)在冰上操作,每管或每孔換新槍頭,避免加樣誤差。 如無(wú)Ct值出現(xiàn)、Ct值出現(xiàn)過(guò)晚、標(biāo)準(zhǔn)曲線線性關(guān)系不佳、負(fù)對(duì)照有信號(hào)、溶解曲線異常、擴(kuò)增效率低等問(wèn)題,需針對(duì)具體情況進(jìn)行調(diào)整和優(yōu)化。

     

     

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